很久以前，无人居住的山里建立有人类最新的研究中心
某日，研究用的main computer突然拥有自己的意识而暴走，人类费尽千辛万苦阻止了暴走，取回了和平……看起来是这样的
回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，而准备了巨大萝卜，并选出战士们进行训练，某日，这一天终于来临了
站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go Buster！！ 他们的战斗，现在开始！