汉武帝将李汉下狱，准备以他的血活祭仙人。
紫薇跪求汉武帝饶恕李汉。汉武帝不允。
紫薇又求李汉改口。李汉坚决不改。
紫薇不得已求秋婵。秋婵却认为，李汉是李陵和胭脂的儿子，就应该宁死不屈。而不是苟且偷生！
处斩之日，李汉走上刑场。紫薇全身戴孝，前去诀别。
秋婵也到刑场，与李汉生离死别。李汉叫她妈妈。秋婵激动地高喊：李勇，胭脂，你们听到了吗？太子恰好还朝，闻讯大惊，赶到刑场，喝令刀下留人！太子向汉武帝要求赦免李汉，动之以情，晓之以理。但李长生借仙人之口，声明不斩李汉，仙药难得。江充也以测字为名，假慈悲以要求给予李汉“身后哀荣”。太子和汉武帝发生激烈冲突。太子要求舍去太子之位，以赎李汉性命。汉武帝赶走太子。但心中恻然，只好遥拜北方，请李勇和胭脂原谅他万不得已。祁连突然赶来。出示人证物证，说明所谓仙人黄帛是李长生喂到牛肚子里的，并非天降仙旨。金童证实。他一直监视李长生的行径。李长生还要抵赖。卫长公主揭露李长生醉卧花丛，已成阉人，但欺君至今。皇帝怎么会派阉人求仙？岂不是对仙人的大不敬？汉武帝震怒，命人验明正身。江充见风转舵，落井下石，说李长生所作所为，早已被开除仙籍，应该一死！汉武帝下令斩首李长生。
刑场上形势突变，斩李汉改为了斩李长生。李汉无罪释放。李长生人头落地。百姓无不拍手称快。太子和李汉等人劫后重逢，经历了生死考验。李汉和紫薇成为人们羡慕的一对。而卫长公主完璧归赵，和金童也终成连理。汉武帝开始怀疑：世界上到底有没有仙人？有没有长生不死药？江充强作镇静，煞有介事，认为不是仙人不灵，是有人诅咒皇帝，抵消了仙人的力量。他提醒汉武帝，当初陈皇后阿娇不就是用蛊惑来诅咒卫皇后吗？汉武帝将信将疑，但求仙如故。并让江充暗中查明蛊惑之祸。同时，司马迁已官复原职，继续编写《史记》。朝臣公孙贺贪污下狱待斩。江充认为时机已到，借审问之机，暗示公孙贺株连立功，许以不死。公孙贺抓住救命稻草，言听计从。承认了他从没有犯过的罪──以盅惑诅咒皇帝。江充带人挖出他原先埋好的盅惑证据，交给汉武帝。汉武帝不意亲眼见到铁证，大为惊怒，下令严审，一查到底。不管牵涉到什么王公贵戚。他认为，求仙不成，原因在此。江充一下子大大扩充了司法权力，指挥廷尉府，每天在各家府大汉天子3分集剧情介绍 第挖掘“盅惑罪证”。一时人心大乱，人人自危。他指使公孙贺咬出卫长公主。果然，他在卫长公主宫内挖出证据。汉武帝不由得不信。将公主下狱。卫子夫不相信女儿会诅咒父亲。汉武帝却认为将她强嫁李长生，引起公主忌恨，顺理成章。
太子急忙求见武帝，为妹妹辩白。汉武帝已走火入魔，高度自信，不为所动。钩戈夫人也急坏了，偷偷问江充，会不会挖到我的宫里？江充要她乐观其成。江充拷打卫长公主，要她供出太子。公主坚决不屈。她以姑姑平阳公主为榜样，宁可一死保护自己的兄弟。江充到处挖掘，一直挖到卫子夫宫内。到处狼籍，连皇后都没有下脚的地方。江充战果辉煌。各种盅惑罪证摆在皇帝面前，最后摊牌，认为除恶不尽，是因为最大的蛊惑要能在太子府内，无法查明。汉武帝决意查明。他故意派太子前往黄河视察河道，调虎离山。又让秋婵安排祁连回家省亲。留出空府，待江充搜查。江充将太子府人员看管，当然如愿以偿，搜出他事先准备好的证物。向汉武帝报功。汉武帝简直不相信自己的眼睛。亲儿子要谋害父亲？钩戈夫人在旁添油加醋，点明太子要做皇帝。故意建议皇帝把皇位让给太子，做太上皇，保个平安。更加激怒汉武帝。秋婵母女发觉上当，派人急忙向太子报信。而太子也正在回京途中──张印见太子来得蹊跷、突然，又得知江充大搜蛊惑之事，深为太子担心，要他立即回京，见机行事。太子刚回太子府，江充已奉旨前来逮捕太子。太子大怒，拔剑相向。季擒虎和李汉等人赶到，杀死校尉，并要向皇帝奏本，洗雪冤枉。江充趁乱逃走。
江充向汉武帝谎报太子造反，马上就要杀进宫来。汉武帝不信，派小太监去探明真相。小太监是江充耳目，根本没有出宫，转了转就跑回来，说太子发动三万人马来“清君侧”。汉武帝信了，狂怒之下，囚禁卫子夫，并派季安世率领禁军镇压太子。并赐其尚方宝剑，先斩后奏。季安世大军一到，太子感到异常严重。季擒虎、李汉等人发动亲兵保护太子。季擒虎和李汉双双力战季安世。太子要季安世反戈一击。但季安世为难地说，我已在太庙盟誓，永不反汉了！金童破狱，欲救卫长公主。但卫长公主已碎舌而死。金童朝天呐喊，
背走卫长公主尚有余温的尸体。太子等人寡不敌众，且战且退，退至太子府坚守。他要李汉、季擒虎各自脱身。李汉等坚决不允，要同生同死。祁连抱着婴儿皇孙前来“领罪”，将皇孙投入汉武帝怀里。这毕竟是汉武帝唯一的孙子。汉武帝抱着孩子不禁反思。金童赶至殿上，双手掐死了江充。小太监供出，一切都是江充安排的。汉武帝大为失悔，下旨饶恕太子，召其进宫。但太子已不相信父皇了。他的左右已伤亡殆尽。季擒虎和李汉也倒在血泊之中。他不愿独活。汉武帝赶来，隔墙召唤儿子，忏悔错误。太子苦笑一声：恕儿臣不能伺候父皇了！言毕吻剑而死。劫后一片缟素，一片哭声。汉武帝踉跄回宫，发现卫子夫上吊自尽──她听说儿子已死，心如死灰，不再伴君伴虎了。一日之间，汉武帝失去了长子，也失去了妻子，家破人亡。一切都是他自己造成的。他狠狠地踢掉那些证物，又毁掉了求仙的“道具”，砸毁了仙宫。他身边剩下的贤臣，只有刚刚赶到的张印、执笔却写不下去的司马迁，还有刚遭失子之痛，正要告老辞官的季安世。还有秋婵、祁连、紫薇等两代寡妇。此时，刘细君却还朝朝觐来了。她满面春风朝见皇帝，追问太子哥哥何在？汉武帝惊讶她青春依旧，勉强问乌孙国王安好？进来的是同样青春的乌孙新国王。汉武帝抱着他们，再也忍不住热泪纵横。汉武帝回到后宫，只有钩戈夫人迎接邀宠，并问太子将是谁？汉武帝强按怒火，抱过小儿子弗陵，却要钩戈夫人自己选择：如果她的儿子做太子，她就必须死掉。否则，刘弗陵就不会成为皇位的继承人！钩弋夫人大惊大悲，终于选择了前者，长吻熟睡的儿子以后，结束了自己的生命。
汉武帝一手抱着幼子，一手抱着孙子，告诉两个还不懂事的孩子：朕百年之后传给弗陵，弗陵以后，传给你的侄儿。。。。。。（大汉天子3大结局完）