谁是艾略•该隐
汤姆化名为马特•巴克利成功取得了亚瑟•萨顿的信任，还受邀参加他与未婚妻格温的订婚宴。亚瑟表面风光其实负债累累，因参加地下比赛打假拳而得罪了俄罗斯犯罪集剧情介绍团，不得不每月支付两万美元补偿他们的损失，这正是汤姆看中他的原因。在订婚宴上，汤姆赶走了讨要钱款的收账人。亚瑟虽然知道汤姆是好心，但心里更担心受到报复。
小剧场里，伊利莎白翻阅着当天的报纸，报道称总统成立了专案组调查伊利莎白的案件，这似乎是寻求真相的好机会。雷丁顿匆匆回来顾不上看一眼报道里的内容，他带来了可怕的消息，一个被称为雪怪的杀手将伊利莎白定为了刺杀目标。雪怪不受雇于任何人，他充当义警身份，确认并找出目标，最后将其杀死。多年来作案数起无一失手，却没人知道他的身份。为了安全，雷丁顿派人来接伊利莎白去另一安全屋，自己则出去寻找帮助。
雷丁顿找的人正是莱斯勒。在互助会里，雷丁顿用枪抵着毫无防备的莱斯勒(莱斯勒曾服止痛药成瘾)，确保自己不会被捕的情况下告诉他有关雪怪的情况。回到行动小组，莱斯勒从档案里查到很多有关雪怪的悬案，其特点就是用自制的子弹杀人。他调查雪怪并非是为了帮助伊利莎白，而是想在雪怪找到伊利莎白时一箭双雕，同时抓住雪怪和伊利莎白。莱斯勒安排好纳瓦比和阿兰姆追查此事，然后赶去国会接受专案组的质询。
小剧场旁僻静的街道上，两名大汉受命保护伊利莎白撤离。突然一发子弹命中其中一人的脑袋，伊利莎白和另一人急忙找地方隐蔽，紧接着另一人也中枪倒地。伊利莎白无法看到枪手地点，急中生智，弯腰跟在一辆路过的出租车后面，前进十几米后突然加速冲进街道旁的小胡同。可子弹似乎从四面八方过来，胡同里也不是安全之地。伊利莎白冒着随时可能飞来的子弹，撬开路边停放的车辆，伏在车座上开车冲出枪手的伏击圈。雷丁顿从阿兰姆口中了解了枪击事件，得知伊利莎白安然无恙后，便询问雪怪的调查情况。阿兰姆只查到雪怪曾使用的子弹来自于一个叫扎德的制枪大师。行动小组不知道去哪找这人，雷丁顿却心里有数。
国会大楼内，司法部的雷文•赖特向莱斯勒介绍了专案组的负责人国家安全顾问劳雷尔•希钦女士。劳雷尔温和热情，头脑犀利，在质询中屡屡戳中要害点。莱斯勒竭尽自己所能为伊利莎白做了最有利的猜测，这算是履行了对雷丁顿的承诺。但很不幸，专案组最终并没有采信支点的相关内容，且因伊利莎白曾自称为俄方间谍，因此要求行动小组必须与中情局的主管卡奇奥普罗斯共享相关情报，以免重蹈当年911情报失误的覆辙。莱斯勒知道卡奇奥普罗斯就是秘社中的主任，却苦于没有证据。共享情报无异于将雷丁顿和伊利莎白交到秘社手中。
纳瓦比正在枪击现场调查，从一枚子弹底部上发现有阳文“圣诗1:1”，引用旧约中的“不从恶人的计谋”，可以证明是雪怪所为。心有余悸的伊利莎白也与雷丁顿汇合，她还是黑名单第一次与死亡这么近。雷丁顿安慰了一会后说出一个好消息，邓比已经按以前约定的方式进行了联络。在去找邓比之前，雷丁顿和伊利莎白先找到了扎德。当制枪大师面对着枪口时也只能说出雪怪的藏身处。在雷丁顿进行审讯时，伊利莎白瞄了一眼桌上凌乱的草图，并没有什么线索。两人马上按地址找到正在制作子弹的雪怪。雪怪哪肯束手就擒，翻窗而出沿着防火梯上到房顶，在房顶上高高低低一路狂奔，伊利莎白紧追其后。在飞跃两幢房屋时，雪怪双手抓住了对面房屋阳台边脚却没有着力点，无力翻上阳台，高高的挂在房屋的外墙边。就在他进退两难时，雷丁顿出现在阳台，一把抓住他的胳膊。在这种形势下，雪怪只说并非他一人，还有其他人会赶来。见雪怪不肯再多说一个字，雷丁顿两手一松，仍由他摔下楼去。
行动小组很快介入了这起坠楼案，从死者的硬盘上，阿兰姆发现了一个悬赏网站。该网站类似于众筹，只不过众筹的项目是刺杀。某人可以在网站上建立刺杀目标，登陆网站的人如果认同此人该杀，就会划入比特币表示支持。当金额达到一定数量后，自然就会吸引到职业杀手。成事后，杀手只要提供证明，众筹到的款项就会划入杀手的帐下。而伊利莎白正是当前该网站中，悬赏金额最高的刺杀目标。发起悬赏的人叫“亚略•该隐”。因网站分散隐藏在世界各地的服务器里，阿兰姆也无法关闭网站。
小公园里，雷丁顿和伊利莎白正在等候邓比，可来的人不是邓比，而是另一个合伙人瓦尔加(见黑名单第二季黑名单第3集剧情介绍)。瓦尔加带来不幸的消息，邓比已经伤重不治。还没来得及哀悼邓比，伊利莎白发现一条线索，她曾在扎德桌上看到过悬赏网站的标记。看来扎德也想拿奖金，他之所以说出雪怪的地址，只是为了减少竞争对手。雷丁顿再次找到扎德逼问亚略•该隐的真实身份。扎德也不知道，但知道网站建立者的网名。得到网名后，雷丁顿随手将一颗子弹射入这个没有职业道德的人渣身体里。纳瓦比很快就根据网名找到了网站建立人加文•德尔加多，并查扣了所有的电脑设备。对这种电脑高手，阿兰姆难得有审讯犯人的机会。从加文傲慢的言语里，阿兰姆分析出网站采用双钥系统，如要删伊利莎白的悬赏除了要加文的密码外，还需要发起人输入密码。加文在从轻处理的条件下交出了自己的密码，但去哪找亚略•该隐呢?
雷丁顿和瓦尔加开车送伊利莎白去一家小型机场，可在停机库房里等待他们的人却是秘社的走狗马汀斯及其手下。雷丁顿审时度势，知道反抗无益，便放下了手里的枪。伊利莎白真想一枪毙了瓦尔加这个叛徒，但也只能放弃这种念头。即使在这种形势下，雷丁顿仍保持着清醒的头脑，知道马汀斯没有当场置他于死地一定是想得到他的情报。于是雷丁顿提出让伊利莎白自由，自己愿说出秘社想知道的任何事。马汀斯并没有接受，他喜欢用另一种方式得到自己想要的东西。看到马汀斯要折磨伊利莎白，被人死死抓住的雷丁顿怒不可遏却又无能为力。就在马汀斯打算像切生鱼片一样杀死伊利莎白时，一辆机场工作车冲了进来，一个死人斜靠在驾驶座上。正在众人把注意力放在工作车上时，邓比突然从背后出现，手持双枪。几声枪响，马汀斯的手下纷纷中枪，瓦尔加也被打伤腿部倒在地上，只有马汀斯反应机敏趁乱逃得无影无踪。雷丁顿获得自由后黑名单第一件事就是安慰伊利莎白，然后举枪打死还在哀嚎的瓦尔加，最后紧紧了拥抱邓比。腰部的一阵巨痛让邓比不支倒地，雷丁顿这才发现邓比受伤。在雷丁顿的安排下，一支秘密医疗队迅速赶来救治邓比，并将他送到附近的安全屋。所有事情做好，雷丁顿才联系阿兰姆。得知只有追踪悬赏金的动向才能逆向追踪到发起人亚略•该隐后，雷丁顿想到了一个办法——杀了伊利莎白。这个任务交给了“卡普兰先生”。虽叫先生却是个女性，她多次帮助雷丁顿清理犯罪现场，擅长处理尸体的她自然知道如何伪造尸体。不一会各大媒体竞相报道重要通缉犯伊利莎白死亡的新闻，并且有图有真相。伊利莎白自己登陆悬赏网站，提供自己的死亡证据，很快网站就自动发来确认邮件，并附有银行代码。在伊利莎白打算电话告诉阿兰姆银行代码时，雷丁顿挂断了电话。他要自己查出谁是发起人。
雷丁顿认识的网络高手从银行代码查出了亚略•该隐的住址。两人敲门，开门的是一个半秃中年男子，并没有什么特别。男子一看到伊利莎白大吃一惊，但对两人所说的网站一无所知。就在雷丁顿口出威胁之时，男子的女儿布莱尔站了出来，她才是亚略•该隐。布莱尔的母亲死于欧俄分析处爆炸案(黑名单第二季20集剧情介绍内容)，这也正是秘社栽赃给伊利莎白的案件之一。布莱尔的父亲因此对伊丽莎白恨之入骨，时常诅咒伊利莎白下地狱。布莱尔失去了母亲，在父亲情绪的感染下就发起对伊利莎白的悬赏。对从小失去母爱，伊利莎白感同身受。她用真诚的态度让布莱尔相信，这件爆炸案并非自己所为。网站上的悬赏终于被删除，伊利莎白临走前向布莱尔保证，一定会找到爆炸案的真正凶手。
汤姆自告奋勇愿为亚瑟解决眼前的麻烦，可当亚瑟和格温看到后备箱里躺着收账人的尸体时，吓得目瞪口呆。
克兰德尔爵士的方舟
一架私人飞机上，伊利莎白为邓比更换了绷带。经过几天的治疗，邓比的伤势已经基本痊愈。即使如此，邓比并不在意自己的身体，反而鼓励着伊利莎白。雷丁顿从驾驶舱回来，坐在沙发上喝着咖啡，提到一个叫安德拉斯•哈尔米的人。他是一名计量经济学家，智商极高，最近被人绑架。同时他也是“主任”最依赖的顾问，根据影子律师马文的分析，其手上掌握的信息对雷丁顿打击秘社的计划非常重要。起初，雷丁顿以为他被绑架只是巧合，可在之后不久又有一名女性计量经济学家失踪。最近过去的六个月里，各领域都有专家失踪，且都是一男一女。雷丁顿据此相信，有人在建设诺亚方舟，以延续这些聪明人类的血脉。所以，为了证明伊利莎白的清白，就必须找到关押着安德拉斯•哈尔米的方舟。
华盛顿FBI行动小组里，莱斯勒、纳瓦比和阿兰姆在办公室里偷偷接听雷丁顿打来的电话。因为专案组要求行动小组必须与中情局的主管卡奇奥普罗斯共享情报，他们三人不得不谨慎行事。雷丁顿要求他们在不让卡奇奥普罗斯知情的情况下寻找哈尔米。可这非常困难，卡奇奥普罗斯及其手下时刻监视着行动小组的一举一动。卡奇奥普罗斯也正在调查行动小组以往的行动，发现他们其实是在为雷丁顿“工作”。莱斯勒指出，只有与雷丁顿保持联系才能接近目标伺机抓捕，而且雷丁顿最近提供的每个案子都抓获了相应的秘社成员。卡奇奥普罗斯一听到秘社的字眼，马上转移了话题，要求莱斯勒对新案件尽快提交报告。
行动小组根据雷丁顿提供的线索，找到了失踪专家的名单。莱斯勒在大屏幕上显示着相关图片信息，向卡奇奥普罗斯进行汇报时，阿兰姆偷偷删除了哈尔米图片，以免引起卡奇奥普罗斯的疑心。最近失踪的是一名西班牙男性数学教授库切拉博士，在相同领域能与他比肩的女性数学家只有美国的安娜•尼霍夫博士。莱斯勒正在联系当地警方，并要与纳瓦比一同前往保护。这点信息并不能让卡奇奥普罗斯满意，他认为雷丁顿一定是在寻找某人，而行动小组在故意隐瞒。
阿灵顿郡的一幢民宅内，尼霍夫博士戴着耳机边听音乐边写着论文。屋外的厢式货车内，三名男子则在准备着捆扎带、胶布等物品。过了一会，尼霍夫看到手机屏幕上的提示，有一条来自FBI的留言，警告她正处于危险之中。这时她也看到窗外有两名男子闯入院子，急忙躲进沙发底下。可手机的震动声暴露了她的位置，被两男子抓住拖进院子外的厢式货车内。幸亏莱斯勒和警方及时赶到，经过一番枪战，击毙两名匪徒，活捉一人。
此时雷丁顿也没闲着，他找来的施工队正在一处旧餐馆内按计划施工。可秉公办事的监理员总是在施工现场，让施工队无法做手脚。马文查到监理员的女友丽莎是一个没天份，却热衷于烘焙点心的准糕点师。雷丁顿找到这位糕点师，极力恭维后，称其男友正在为她装修餐厅。丽莎欣喜异常，迫不及待的到施工现场察看。看着女友兴奋的样子，再加上雷丁顿承诺事后餐厅归其所有，监理员终于放下自己的原则，同意给雷丁顿一天的自由施工时间。
FBI的审讯室里，被活捉的人犯对莱斯勒的问话不理不睬。卡奇奥普罗斯亲自上阵，用上了恶毒的威胁家人手段，终于知道了雇凶绑架的人是亿万富豪克里斯潘•克兰德尔爵士，而被绑架的人都送到波士顿地区机场附近的一栋楼里。就在行动小组前往波士顿时，卡奇奥普罗斯到一处天台见了马汀斯。马汀斯有自己的情报网，他知道卡奇奥普罗斯的手下已经从FBI的文件系统中发现阿兰姆删除安德拉斯•哈尔米的照片。卡奇奥普罗斯承认哈尔米是秘社的高级顾问，因此必须找到他。只是向来多疑的马汀斯并不完全相信他的话。
莱斯勒和纳瓦比带着武装人员赶到机场边的建筑物里，砸开门禁系统后才发现，里面是成排的人体冷冻室，每个冷冻室里都放置着一个被冰冻的人体。这是克兰德尔爵士的业务之一，为有绝症的人提供冷冻服务，只等以后医疗技术发达后再解冻复活。业务完全合法，并且每个被冷冻的人都签订了服务合同。被绑架的人并不在其中。员工不愿意与警方多谈，要讯问克兰德尔爵士本人也比较困难，因为他常年居住在自己的A380飞机上，很少着陆。阿兰姆根据航空部门的纪录查到过去三年里，他的飞机只着陆过三十余次，时间正好都与绑架案日期吻合。原本今天有着陆计划但又取消，很可能是因为绑架尼霍夫失败。基本可以判定这架飞机就是克兰德尔的方舟，被绑架的精英都在飞机里处于冷冻状态。莱斯勒马上下达禁飞令，禁止加油机升空。
雷丁顿从莱斯勒处得到了这个消息，马上采取行动，联系克兰德尔的座机改变航道，以免落入FBI的陷阱。他要在FBI之前找到哈尔米。行动小组此时收到国安局的卫星情报，一架A380正飞向加拿大地区的机场。等莱斯勒和纳瓦比与加拿大骑警联系前往该机场后，不远处的卡奇奥普罗斯拿出手机，通知马汀斯赶往匹兹堡的一家机场。他利用权力给了莱斯勒错误的卫星情报，而通知马汀斯到正确的着陆地点找到哈尔米的尸体，并找机会干掉雷丁顿。马汀斯不明白，如果哈尔米已经死了，为什么雷丁顿还要找他。卡奇奥普罗斯没有回答，只要他尽快完成任务。
汤姆杀死收账人，引起了查理犯罪集剧情介绍团的注意，很快就有人找上门进行报复。汤姆帮助亚瑟的未婚妻格温离开，随后自己和亚瑟被查理派来的打手一顿痛打。不知道过了多久，汤姆在一片荒废的厂区醒来，脖子上锁着项圈。项圈上连着一根粗铁链，铁链的另一头正拴着亚瑟脖子上的项圈。查理的规则很简单，两人之中必须死一个，谁生谁死由两人自己决定。在一群围观人叫喊声里，亚瑟知道只有与汤姆以死相搏才有一线生机。汤姆原本只想自行与查理解决，但看来不分出胜负，就不可能见到查理。于是汤姆只能对亚瑟痛下杀手，用刀片割开了他的颈动脉。曾视汤姆为知己的亚瑟成了牺牲品。
阿兰姆发现国安局的情报有误，可莱斯勒和纳瓦比已经在飞往加拿大的飞机上。莱斯勒意识到进了“主任”的圈套，马上改变航线飞往匹兹堡。在匹兹堡机场里，A380正在补给燃料，它的主人克兰德尔爵士则在与雷丁顿谈着交易。雷丁顿不需要爵士支付燃料费用，只想要安德拉斯•哈尔米。自视为上帝的克兰德尔怎么可能让其他人打扰自己的计划，断然拒绝。雷丁顿直接拔枪，爵士还没反应过来子弹就穿过了他的心脏。门外的工作人员听到异常声响，冲进屋内看到已经身亡的爵士，赶快召集剧情介绍医护人员，为爵士进行冷冻。雷丁顿和伊利莎白则趁乱进入飞机后部改造出来的冷库内，找到冰柜里的哈尔米。剪下哈尔米的两个拇指后，雷丁顿和伊利莎白正要离开，发现马汀斯带人登上了飞机。马汀斯等人刚进入冷库，躲在角落的雷丁顿和伊利莎白冲了出来边开枪边后退。等马汀斯反应过来，雷丁顿已经关闭冷库大门，逃得无影无踪。过了不久，FBI也到达了机场，可莱斯勒和纳瓦比只找到冰柜里的失踪人员和已经冻成冰棍的克兰德尔爵士的尸体，所幸救出了还未被冷冻的库切尔博士。
卡奇奥普罗斯从马汀斯处得知雷丁顿取走了哈尔米的拇指，立刻知道雷丁顿是要取走哈尔米在银行保管的物品，马上以司法部的名义前往银行收缴哈尔米名下的保险箱。可在他抵达前，雷丁顿早已从装修餐厅里面开通的暗道进入了银行金库，用哈米尔拇指打开保险箱。卡奇奥普罗斯拿到的只是被丢在保险箱里的两根拇指。
FBI总部，莱斯勒从克兰德尔爵士座机上的监控里发现了马汀斯的身影。他相信这个人就是卡奇奥普罗斯的走狗，有了这个证据，或许能说服司法部取消与中情局共享情报的命令。同时雷丁顿正在电话里与卡奇奥普罗斯进行着谈判。持续对秘社进行打击，迟早会让秘社成员下决心干掉卡奇奥普罗斯以避免损失扩大。卡奇奥普罗斯也早有准备，为跑路窃取了秘社数百万美元的资金。雷丁顿从哈米尔保险箱里取走的正是这一大笔钱。没有了这笔钱，卡奇奥普罗斯就无法脱身。只要卡奇奥普罗斯还给伊利莎白清白，雷丁顿就会停止对秘社的打击行动，大家都能恢复到以前的生活。但卡奇奥普罗斯并没有就此认输，拒绝了这一提议。
汤姆矫健的身手引起了俄国人的兴趣，查理破例想见见这个厉害的家伙。可汤姆的目标是坐在他身边的卡拉库尔特。看到了自己要找的目标，汤姆三下五除二干掉查理和他的保镖，打晕了卡拉库尔特后，拖着他一步步走出废旧的厂区。