为了监视一名新可疑对象，Reese和Shaw假扮某高中的毕业生参加校友聚会活动。
与此同时，Finch和Fusco前往华盛顿特区调查“Vigilance”组织最近一次攻击行动的真实动机。
Reese假扮特勤处特工接近并保护最新的可疑对象——一名国会议员。
要想阻止Decima将第二台机器上线运行，此人的作用举足轻重。
Decima组织利用Samaritan(Finch在麻省理工学院的同学Arthur Claypool发明的一种类似「机器」的东西)提供的信息及其网络来追踪Reese和Shaw。
Greer利用Finch最大的弱点来引诱他现身：他对前未婚妻Grace Hendricks(Carrie Preston)永不消逝的爱。
一股来历不明的势力阻止机器洞察一件即将发生的灾难事件的全貌，机器同时吐出五个不同的号码，Finch的团队只能自行调查相关线索并解开这个谜团。
与此同时，Root的黑客团队抵达纽约。
邪恶的人工智能项目“Samaritan”即将上线运行，Finch和他的团队会成为它的首批目标，这迫使他们采取一切可能的行动来阻止这件事情的发生。
与此同时，他们与反监控“恐怖”组织Vigilante长达数月的战争有了一个令人震惊的结局。